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一類新的稱為環狀 RNA(circular RNA, circRNA)的 RNA 可能發揮著一種有趣的作用發表時間:2019-06-25 14:21 隨著新技術允許科學家們深入研究基因組和外顯子組,一類新的稱為環狀 RNA(circular RNA, circRNA)的 RNA 可能發揮著一種有趣的作用。 在一項新的研究中,來自美國密歇根大學的研究人員對多種癌癥中的 circRNA 進行了編目,并進行了初步研究,表明這些穩定的結構可能作為血液或尿液中的癌癥生物標志物。相關研究結果發表在 2019 年 2 月 7 日的 Cell 期刊上,論文標題為「The Landscape of Circular RNA in Cancer」。 circRNA 是一種非編碼 RNA,它們形成閉合的環狀結構而不是線性結構。新的 RNA 測序方法曝光了這些 circRNA,但是人們對它們起作用的原因或方式知之甚少。不過它們的穩定結構使得它們成為癌癥生物標志物的理想候選對象。 這項新的研究確定了癌癥中的 circRNA 目錄,從而為未來的研究構建了一個數據庫。論文共同通訊作者、密歇根大學轉化病理學中心主任 Arul M. Chinnaiyan 博士說,「我對 circRNA 作為非侵入性生物標志物的潛力感到非常興奮。鑒于它們的穩定性,我們可能能夠在癌癥患者的血液或尿液中檢測到它們。這可能對癌癥的診斷或預后有用。」 作為 MiONCOSEQ 項目的一部分,這些研究人員從 800 多個腫瘤樣本中發現了 circRNA。他們證實為 MiONCOSEQ 項目開發的捕獲 RNA 測序在檢測 circRNA 方面比現有方法更為強大。 Chinnaiyan 說,「這種捕獲方法可能是有限的,這是因為它基于我們用來捕獲 RNA 的探針。但是,全外顯子組捕獲方法使得它具有重大的意義。我們通過這種方式捕獲大量的 RNA。這就是為何我們能夠鑒定出如此多的之前并不知道的 circRNA。」 這種技術僅需少量總 RNA 就能夠鑒定出 circRNA。這意味著它們可能在 RNA 被稀釋的地方被檢測到,比如血液或尿液。 此外,這些研究人員還鑒定出幾種在前列腺癌組織中發現的 circRNA。通過評估來自前列腺癌細胞的 circRNA,他們發現它們比線性 RNA 更穩定。它們也可在尿液樣品中檢測到。 Chinnaiyan 說,「我們能夠證實這些 circRNA 存在于尿液中并且來自前列腺癌的 circRNA 可被檢測到。我們未來的研究將探究這些 circRNA 作為尿液或血液中的癌癥生物標志物。」 這些研究人員將他們的研究結果轉變為一個名為 MiOncoCirc 的數據庫,這個數據庫對腫瘤樣本中報道的 circRNA 進行編目。這種資源可供科學家們使用,有助于開發新的癌癥生物標志物。 |
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